任何手术都有一定的风险，腰椎间盘突出症手术也不例外。手中有可能出现：
(1)术中出血及血肿形成：主要是椎管内静脉破裂出血，有时影响手术进行，可以直视下双极电凝止血。
(2)血管损伤：后路腰椎间盘摘除手术时，如果髓核嬲刮匙进入过深，有可能穿破纤维环前壁损伤位于腹部的大血管。
(3)硬脊膜损伤：术中发现硬脊膜破裂，脑脊液外溢，可以用无损伤缝线缝合硬脊膜，一般不会留下严重后遗症。
(4)马尾神经损伤：较大的中央型腰椎间盘突出，术中需要将马尾向两侧过度牵拉，有时会出现牵拉伤，大多数为可逆性损伤。
