除了术中可能发生一些并发症以外，手术后短期内局部有可能出现一些并发症，包括：
腰椎间盘突出症可能有并发症(1)硬膜外血肿：较大的血肿会造成神经根及马尾受压，应及早手术清除。
腰椎间盘突出症可能有并发症(2)下肢疼痛未消失：可能由于髓核摘除不完全，或患者术后活动不当，或神经根管狭窄压迫未解除。若术后疼痛消失，一段时间以后复发，或健侧肢体出现疼痛，最常见的原因是继发退行性改变引起椎管或神经根管狭窄，或其他节段有新的突出。视情形可能需要再次手术。
腰椎间盘突出症可能有并发症(3)腰椎间隙感染：如果术后1周左右出现剧烈腰痛及腰肌痉挛，伴低热、白细胞升高，应考虑腰椎间隙感染给予抗生素治疗和石膏固定。
腰椎间盘突出症可能有并发症(4)其他：另外还可能有一些远期并发症如：脊柱融合失败、内固定器械松动断裂、脊柱不稳定、脊柱畸形、神经根粘连、椎间盘摘除术后复发等。
